421 000 лв. е дала Комисията за защита на личните данни за наем на сградата, в която се помещава. Тази констатация е отчетена в доклад на Сметната палата за проверка на финансите на структурата за календарната 2007 г. Според проверката въпросната сума е огромен процент от разходите за издръжка на комисията. Други 546 000 лв. комисията, призвана да защитава личните данни на българските граждани, дава за заплати, отчитат одиторите. Бюджетът на звеното за 2007 г. е бил 1.938 млн. лв. и е усвоен на 80%.

Сметната палата е установила нарушения при разходването на парите за командировъчни. В някои месеци в заповедите не е записано изискването "пътуването да се извърши по най-краткия или по икономически най-изгодния маршрут". Това е довело до надвишаване на разходите по пътуване и дневните пари на служителите. В някои случаи те не са отчитали и свършената работа след командировките, включително и в чужбина, пише още в доклада на Сметната палата. Не е бил установен и лимит на мобилните телефони на ръководството на комисията. В края на 2007 г. общият брой на щатовете в комисията е 76, като 25 от длъжностите са били незаети. Одиторите са отправили общо 15 препоръки за отстраняване на нередностите.