Конгресът реши в новия устав на БСП да запише, че министрите, депутатите, областните управители и шефовете на агенции няма да имат право да са и шефове на общински, градски и областни партийни съвети.

Този текст предизвика и най-бурна полемика в зала 1 на НДК. Срещу него се обявиха настоящи депутати, които са и председатели на местни партийни организации. Депутатът Димитър Дъбов, който е шеф на шуменската организация, предупреди, че ще трябва да започнат наново избори за ръководства по места. Бойко Великов обаче успокои, че промените ще влязат в сила едва от следващата отчетно-изборна кампания, която ще е след 3 г. Румен Овчаров обяви решението като "формално правилно, но по същество изключително погрешно". Според него така ще се създадат две абсолютно независими системи, като партийните органи ще се опитват да диктуват на изпълнителната власт, а тя - да им се отчита. Овчаров подчерта, че при сегашната система има достатъчно механизми за контрол и предупреди, че се създава лоша среда за едно бъдещо правителство. Министърът на икономиката Петър Димитров, който е лидер във Варна, определи предложението като политически абсурд. Депутатът Мая Манолова, която води организацията в Кюстендил, предупреди, че ще е грешка да се лишат депутатите да работят и като шефове на областни съвети.

Въпреки всичко конгресът прие текста. Това предизвика бурен спор дали има кворум и с колко гласа трябва да бъде гласувано предложението. В крайна сметка то остана така, а депутатът Ненко Темелков, който е местен лидер в Перник, възнегодува, че така се създават 2 центъра на властта в съответните общини и области. По-късно и Сергей Станишев обясни, че според него промяната не е била толкова необходима. Той самият гласува против.