НАСА спира всички полети на совалки до изясняване на причините, а графикът за бъдещи мисии става неясен, съобщи Рон Дитмор, директор на програмата за космическите совалки на НАСА. Макар че американският президент Джордж Буш заяви в словото си след гибелта на "Колумбия", че американската космическа програма ще продължи, над НАСА са надвиснали тъмни облаци, посочва АП. Подобна ситуация преживя космическата агенция след експлозията на "Чалънджър" през 1986 г. с орязване на бюджета, загубата на квалифицирани специалисти и натиск за осъществяването на повече мисии за по-кратко време.

След гибелта на "Чалънджър" програмата на НАСА за совалките бе замразена, докато така наречената "Комисия Роджърс", натоварена да разследва катастрофата, въведе промени в структурата на агенцията. Програмата бе подновена две години по-късно и пусковете бяха фиксирани на 8 годишно.

През 1995 г. бюджетни ограничения доведоха до съкращаването на сроковете между пусковете, а 2800-те специалисти, обслужващи совалките, бяха съкратени наполовина през 2000 г. Това доведе до опасения, че се прави компромис със сигурността на мисиите.

Бъдещето на НАСА е свързано също с предефиниране на нейното устройство. През 90-те години НАСА предаде управлението на мисиите на совалките на частен контрактор - базирания в Хюстън "Юнайтер спейс алаянс", смесено дружество между "Рокуел интернешънъл" и "Локхийд Мартин". Трансформацията предизвика много оплаквания на служители на НАСА, които призоваха за повече контрол от страна на правителството върху агенцията.