Министерството на екологията е на път да се изправи пред сериозен проблем с питейната вода в селата и малките градове. Там водата е с влошени микробиологични показатели според годишния доклад за състоянието на околната среда за 2007 г., внесен преди дни в парламента. Въпреки че той е за минала година, положението е без промяна и сега. Екипът на Нона Караджова дори спря проектите за водоснабдяване и канализация тъкмо в този тип селища заради съмнения, че предишното ръководство на министерството е финансирало населени места на партиен принцип.

Най-голямо несъответствие в микробиологичните показатели на питейната вода са отчетени в областите Видин (16.2%), Габрово (13.4%), Хасково (13.1%), Пазарджик (12.6%), Ямбол (11.2%) при допустима норма 5%. В Бургас, Перник и Стара Загора също питейната вода е с влошено качество. Отклонения при нитратното съдържание, които влияят предимно на кърмачетата и малките деца, са констатирани най-много в областите Стара Загора, Ямбол, Шумен, Русе. В някои зони превишението достига до пет пъти над допустимото. Най-мътна и с неприятен вкус питейна вода пият в Разград, Габрово и Хасково.