Сметната палата ще проверява Комисията за установяване на имуществото, придобито от престъпна дейност (по-известна като комисията "Кушлев"), правителствения Авиоотряд 28, Държавната комисия по енергийно и водно регулиране, Националната агенция за приходите. Това предвижда планът на ведомството за 2007 г., внесен за одобрение в Народното събрание. Експертите на палатата ще проверяват как ведомствата харчат бюджетните пари и стопанисват повереното им имущество. Предишна проверка на палатата в комисията "Кушлев" предизвика скандал, след като одиторите откриха, че председателят си е отредил 7000 лв. заплата.

Проверки ще има още в Правителствена болница, ВМА, СЕМ, Агенцията за държавни вземания. Одитори ще влязат и в държавния резерв, Комисията за защита на потребителите, агенцията за младежта и спорта. Ще бъде проверено и управлението на компанията "Публични инвестиционни проекти", която бе създадена от предишното правителство с пари от бюджетния излишък. Принципал на държавната фирма е финансовият министър. Агенция "Митници" пък ще бъде инспектирана как е усвоила парите по ФАР за създаването на интегрираната информационна система.